Si no conoces Backtrack quizá deberías visitar la web de remote-exploit.
Vamos a instalarla en un pendrive (de 1GB o mayor para que quepa). Los pasos son los siguientes:
1-. Bajamos el iso (bt3final_usb.iso)
2-. Copiamos el contenido al disco usb (damos por hecho que previamente el disco está vacío y particionado con una partición fat (o fat32). Para copiarlo podemos abrir el iso con, por ejemplo, winrar si lo hacemos en Ms Windows, o podemos montarlo en modo loop en gnu/linux (mount -o loop bt3final_usb.iso bt3/). Una vez tenemos el contenido disponible lo copiamos al disco usb.
3-. Hacer el pendrive arrancable. Para ello ejecutamos un script (bootinst.bat en Windows o bootinst.sh en gnu/linux). Es posible que necesitemos disponer de permisos de administrador. En principio no debería haber problemas pero se impone leer con atención los mensajes que muestra el script.
Para más detalles visita el wiki de remote-exploit.org
Información extraida de http://lucas-coudures.blogspot.com/2008/07/instalar-backtrack-3-final.html